Emniyet Genel Müdürlüğü bünyesinde yapılan yeni görev dağılımı kapsamında, eski İstanbul Emniyet Müdürü Mustafa Çalışkan Emniyet Genel Müdür Yardımcılığı görevine getirildi. Çalışkan, yeni yapılanma doğrultusunda Kaçakçılık ve Organize Suçlarla Mücadele, Narkotik, Özel Harekat ile Terörle Mücadele daire başkanlıklarının yönetiminden ve koordinasyonundan sorumlu olacak.
Mustafa Çalışkan, İstanbul Emniyet Müdürü olarak vazife yürüttüğü süreçte dönemin İçişleri Bakanı Süleyman Soylu ile yaşadığı anlaşmazlıklarla kamuoyu gündemine yansımıştı. Bu süreçte Soylu’nun oğlunun kullandığı aracın polis kontrolünde aranması ve akabinde gerçekleşen telefon görüşmesinde Çalışkan’ın Bakan Soylu’nun çağrısını meşgule attığı öne sürülmüştü.
İki isim arasındaki gerilimin bir diğer boyutunu ise Sedat Peker’e sağlanan polis koruması tartışması oluşturdu. Peker, yayımladığı bir videoda Soylu’ya yönelik ifadelerde bulunmuştu:
Bana koruma polisini sen vermedin mi?
Dönemin İçişleri Bakanı Soylu koruma tahsisinde Çalışkan’ın Terörle Mücadele Şube Müdürlüğü dönemine işaret ederken, ilgili görevlendirme belgesinde Çalışkan’ın imzasının yer aldığı da iddialar arasında yer almıştı.
Hakkında açığa alınabileceğine dair iddialar ortaya atılan Çalışkan ise tepkisini şu sözlerle dile getirmişti:
Türkiye’deki en dürüst insanı neden dolayı açığa alacaklar çok merak ediyorum. Çıksın bir görelim bakalım. Türkiye’de insanlar var. Dürüst siyasetçiler var. En başta Sayın Cumhurbaşkanı var. Mustafa Çalışkan gibi bir insanı açığa kim alacak, nasıl alacak bir görelim bakalım. Çok merak ettim
